通过分子生物学方法能够检测尿液或血液中肾癌相关的标志物，如DNA微卫星改变、VHL基因突变或超甲基化、肾细胞癌特异性蛋白如CA-9表达以及VEGF等血管生成因子的表达上调等。对于家族性肾细胞癌、VHL综合征等具有遗传性的肾细胞癌高风险的患者，进行肿瘤标志物检测具有积极意义。但是目前还没有在临床广泛应用。